公开(公告)号 | CN1930302A |
公开(公告)日 | 2007.03.14 |
申请(专利)号 | CN200380110979.8 |
申请日期 | 2003.12.09 |
专利名称 | 用于检测临床样品中的病原分枝杆菌的方法 |
主分类号 | C12Q1/68(2006.01)I |
分类号 | C12Q1/68(2006.01)I |
分案原申请号 | |
优先权 | |
申请(专利权)人 | 印度科学工业研究所 |
发明(设计)人 | 拉哈·哈里·达斯;阿贾伊·库马尔;梅格帕蒂·辛格 |
地址 | 印度新德里 |
颁证日 | |
国际申请 | 2003-12-09 PCT/IB2003/005767 |
进入国家日期 | 2006.07.07 |
专利代理机构 | 北京银龙知识产权代理有限公司 |
代理人 | 钟 晶 |
国省代码 | 印度;IN |
主权项 | 检测临床样品中病原分枝杆菌的方法,所述方法包括以下步骤: a.通过常规方法净化临床样品,去除包括粘液的污染物, b.用改进的裂解缓冲液处理步骤(a)所得的经处理的临床样品以使活病原分枝杆菌失活,从而使过程对使用者安全, c.利用改进的方法,从步骤(b)所得的经处理的临床样品中提取基因组DNA,从而提高DNA的产量和质量, d.从步骤(c)所得的DNA设计用于检测病原分枝杆菌的序列SEQ ID No.4,所述设计的序列包括步骤(c)所得DNA所选出的SEQ ID No.3的基因间区域、含SEQ ID No.l的mmaAl基因部分的侧翼区域和SEQ ID No.2的mmaA2基因部分, e.设计并合成一套用于扩增SEQ ID No.4的反向引物的特异寡核苷酸引物,其中SEQ ID No.5的为正向引物,和SEQID No.6为用于聚合酶链式反应(PCR), f.开发用于特异性扩增(d)的SEQID No.4的PCR扩增过程,所述过程包括使用步骤(e)中设计并合成的特异性寡核苷酸引物,用于检测临床样品中病原分枝杆菌的存在,和 g.通过限制酶片断长度多态性(RFLP)分析PCR扩增产物,用于区分病原分枝杆菌菌种,用于快速评估HIV的共感染。 |
摘要 | 本发明涉及检测诸如痰、脑脊髓液、胃洗出物和组织活体检测物等临床样品中的病原分枝杆菌,其特征在于,利用设计的寡核苷酸引物对来延伸本发明的新DNA,所述寡核苷酸引物对能特异扩增来自于临床样品的靶DNA,所述DNA位于甲基分枝菌酸合成酶基因mmaA1和mmaA2之间的基因间区域以及mmaA1和mmaA2基因中的侧翼区域。 |
国际公布 | 2005-06-23 WO2005/056831 英 |