公开(公告)号 | CN1195070C |
公开(公告)日 | 2005.03.30 |
申请(专利)号 | CN03113427.0 |
申请日期 | 2003.05.09 |
专利名称 | 一种检测多种传染病的检测型基因芯片及应用 |
主分类号 | C12Q1/68 |
分类号 | C12Q1/68 |
分案原申请号 | |
优先权 | |
申请(专利权)人 | 陶开华;李越希 |
发明(设计)人 | 陶开华;李越希;张锦海 |
地址 | 210002 江苏省南京市中山东路293号南京军区军事医学研究所 |
颁证日 | |
国际申请 | |
进入国家日期 | |
专利代理机构 | 南京苏科专利代理有限责任公司 |
代理人 | 奚胜元 |
国省代码 | 江苏;32 |
主权项 | 一种检测多种传染病的检测型基因芯片,其特征在于芯片包括(1)多种传染病的多种检测寡核苷酸探针和质量控制寡核苷酸探针;(2)寡核苷酸探针通过手臂分子固化在载体材料上形成的探针阵列;所谓的多种传染病的检测型基因芯片是指检测流行性出血热、恙虫病、钩端螺旋体病、血吸虫病、疟疾、霍乱、大肠杆菌0157:H7引起的出血性肠炎七种病的寡核苷酸阵列;所谓的寡核苷酸探针是指能与目的基因杂交的多聚核苷酸,长度在十到五十个碱基;所谓的检测寡核苷酸探针是指化学合成的多种重要传染病病原体的基因保守区、毒力因子序列、基因型及亚型的互补的寡聚核苷酸,毒力因子序列探针包括了病原体致病所必须的多种基因序列的探针,基因型及亚型决定区的探针包括多种基因型和和多种亚型探针;所谓的质量控制探针至少包括二种探针,即阳性对照,阴性对照;阴性对照用于检测杂交信号错误或污染,阳性对照用于检测是否正常杂交和准确定位;所谓的手臂分子指具有双活性基团的长链有机化合物;所谓的寡核苷酸探针固定为寡聚核苷酸的末端有一特定基团,固化在载体材料基质表面时,与表面修饰的手臂分子的末端基团形成共价键;7种病原体的14个特异性基因探针如下:流行性出血热病毒S基因探针2个:HantProbe2:5’NH2-TTTTTTTTTTACCAAGGAGGCTAACTGCTGCTGTAT3’负链R22Probe1:5’NH2-TTTTTTTTTTCATGATCGGGAGAGTGTCGCAGCTT3’正链恙虫病立克次体56KD蛋白基因探针1个:OrientProbe:5’NH2-TTTTTTTTTTTTCAGCTAGTGCGATAGAATTGGGTGA3’正链钩端螺旋体23SrDNA基因探针1个:LepProbe1:5’NH2-TTTTTTTTTTCATGAACTTTGGGGCCTTAAACGACG3’负链血吸虫5D抗原基因探针1个:SchiProbe1:5’NH2-TTTTTTTTTTAGTCATCTCAACAGGTCAGCATATTG3’正链疟原虫ssrRNA基因探针2个:间日疟原虫PvProbe2:5’NH2-TTTTTTTTTTTAGCAAAATGCGCACAAAGTCGATACG3’负链恶型疟原虫PfProbe2:5’NH2-TTTTTTTTTTATGAACTCAATCATGACTACCCGTCTG3’负链霍乱弧菌基因探针3个:外膜蛋白ompWprobe1:5’NH2-TTTTTTTTTTTTGCCTCGGTAGTACCTAATGACAGTA3’正链外膜蛋白ompWprobe2:5’NH2-TTTTTTTTTTTTAGTTTTGAAGTCCTCGCTCGTACGCCA3’正链霍乱毒素基因CtxProbe2:5’NH2-TTTTTTTTTTTATATTTGGGAGTATGGAATCCCACCT3’负链大肠杆菌0157:H7基因探针4个:0157Probe1:5’NH2-TTTTTTTTTTGGTGGAATGGTTGTCACGAATGACAAA3’正链H7Probe1:5’NH2-TTTTTTTTTTGACGATGCAGGCAACTTGACGACTAA3’正链Vt2Probe2:5’NH2-TTTTTTTTTTAGATGGTCAAAACGCGCCTGATAGAC3’负链Vt1Probe:5’NH2-TTTTTTTTTTGGATGACGTAACCATTAAAACTAATGCC3’正链 |
摘要 | 本发明一种检测多种传染病的检测型基因芯片及应用涉及的技术领域是医学检验和基因芯片技术。是一种用于传染病检测的基因芯片,对流行性出血热、恙虫病、钩端螺旋体病、血吸虫病、疟疾、霍乱、0157∶H7引起的出血性肠炎等7种主要传染病进行检测、分型或鉴定毒株。分别从流行性出血热病毒的S基因、东方立克次体的56KD蛋白基因、钩端螺旋体的23SRNA基因、血吸虫的5D抗原基因、疟原虫的SSrRNA基因、大肠杆菌0157∶H7的0157抗原基因、H7抗原基因及毒素基因、霍乱孤菌的外膜OWP蛋白基因及毒素基因内选择特异性的基因探针和PCR引物。其特征在于芯片包括:(1)多种传染病的多种检测寡核苷酸探针和质量控制寡核苷酸探针;(2)寡核苷酸探针通过手臂分子固化在载体材料上形成的探针阵列。 |
国际公布 |