2015年度杭州医学会议暨浙江大学第46期基因组科学研习班简章
会议日期：2015.08.21-2015.08.28
会议地点：杭州
联系人：代成林
联系电话：18757558672
E-mail：daichenglin@zju.edu.cn
开 班 时 间：2015年08月21日-08月28日
上 课 地 点：杭州 浙江大学华家池校区
随着众多生物基因组测序项目的完成，生物学数据正在加速度增长。如何科学地分析和注释这些高通量数据，已成为生物学工作者急需学习和解决的问题。
浙江大学“基因组科学”研习班邀请北京基因组所于军教授、胡松年教授为您讲授基因组学基础知识和前沿进展、基因转录组的测定及分析、基因芯片、二代测序等实验技术的关键事项；浙江大学杨军教授、陈铭教授等讲解系统生物学及高通量分析研究方法和思路。
本研习班多次获得浙江大学优秀项目创新奖，目前已举办45期，学员来自全国30余个省市，累计培训学员4350余名。每次研习班不乏教授、博导参加，更受到博士后、硕博生等年轻学者的青睐。他们中有一些带着课题或问题前来交流和联系，不少学员通过本研习班建立了长期协作关系，共同申请国家973、863课题，共同发表论文，其中不少优秀的研究成果，已在SCI期刊上发表。
一、培训班上课内容
上课内容涵盖“基因组学—蛋白质组学—系统生物学”的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。
核心课程包括：
1. 基因组的比较研究、DNA测序技术原理与进展（讲课人：于 军 教授)
2. 转录组的测定与分析、大规模测序方法及应用、微生物基因组学（讲课人：胡松年教授)
3. 系统生物学建模分析及高通量分析技术应用（讲课人：杨军、陈铭教授等)
4. 蛋白质组学概论及应用 （讲课人：钟伯雄教授)
二、培训班上机内容
上机实习课采用 “跟我学”方式，学习实践各类基础生物信息学软件，每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法www.med126.com。
主要内容如下：
实习一： 基因组数据注释和功能分析
通过序列比对工具BLAST的学习，了解基因功能注释的原理；介绍多序列联配工具ClustalX及分子进化分析软件MEGA4，掌握系统发生树绘制的基本方法，认识基因复制在进化上的功能。
实习二： 核苷酸序列分析
学习基因序列分析常用的数据库和软件，包括：基因预测，编码区结构分析，选择性剪切分析，基因启动子预测，基因调控元件预测，密码子偏好性分析等内容。
实习三： 芯片的基本数据处理和分析
使用TM4软件来实现芯片的数据采集，低质量过滤，标准化处理及聚类等可视化分析；使用GenMAPP软件挖掘芯片数据在代谢途径中的生物学意义；介绍NCBI GEO数据库，学习检索和提交芯片数据。
实习四：蛋白质结构与功能分析
从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始，接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析，预测目标蛋白的生物功能。
实习五： 蛋白质组质谱分析
使用X！Tandem、Mascot、Sequest等软件鉴定蛋白质质谱数据，将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白；使用TPP软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。
实习六：系统生物学软件实习-----网络结构显示与分析
利用Cytoscape系统生物学分析软件，分析蛋白－蛋白相互作用，展示分子网络系统，并与基因表达等数据整合。
三、培训对象
1. 无生物信息学背景，希望了解生物信息学的学员；
2. 计划开展各类组学研究的科研人员；
3. 已有组学数据需了解分析方法的研究人员；
4. 有志从事生物信息学相关工作的学生或者技术人员。
四、报名方法
若有参加意向，请直接将回执发至genetrain@zju.edu.cn，我们会即刻回函并在浙江大学继续教育系统录入，待排定课表后发给您详细课程表。待您再次确认后，发给您报到通知并排定上机号。培训结束，发放浙江大学继续教育证书。
五、教材
“DNA和蛋白质序列数据分析工具”（第三版)， 薛庆中等编著，科学出版社出版 2012年6月发行。如需额外购买可联系会务组
六、其他事项
收费标准：注册费为￥3000/人（包含培训费、教材费、资料费；现金、刷卡或转账) 食宿统一安排，费用自理。
联 系 人：代成林 18757558672 咨询电话：0571-88206579
电子邮件地址：genetrain@zju.edu.cn; daichenglin@zju.edu.cn
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